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常见植物源性有机肥原料
秸秆类：常见的原有玉米秸秆、小麦秸秆、豆秸秆、水稻秸秆。含有高的纤维素和木质素等大分子物质，氮磷钾等养分含量较低（除豆科类），单独用这类物料做有机肥的罕见，一般用来增加发酵物料的有机质，调节碳氮比。这类原料比较丰富，价格低廉，但因这些物料多存在农业从事散户手中，大面积收购比较困难，且季节性较强，全年生产需提前备货。
粕类：有豆粕、棉粕、蓖麻粕、花椒粕、花生粕等多为农产品加工产业的下脚料，多为辅料。粕类为原料的有机肥可称得上为高端有机肥，因其多为饲料级，原料成本较高，发酵腐熟不宜控制。
菌糠：俗称蘑菇渣、菌包，有金针菇渣、平菇渣、杏鲍菇渣等，原料多为酒糟、玉米芯、稻壳粉、麦麸、豆粕及配一些营养元素，菌糠有机质高、富含菌体蛋白、维生素、微量元素及生长素，做有机肥在肥力效果较好。
羊粪
常见动物源性有机肥原料
动物粪便：羊粪、猪粪、牛粪等都是比较好的有机肥原料。有机质含量高，但由于纤维含量少不易分解。使用时要经过充分腐熟发酵，高温杀灭病虫卵、菌和杂草种子。
动物加工废弃物：加工废弃物，甚至是养殖废弃物等也能成为有机肥的原料。通常采用的是无公害生物降解法。
玉米酒糟
工业废弃物
工业残渣：酒糟、醋糟、木薯渣、糖渣、糠醛渣、木质素渣、乙醇渣等此类原料市场规模较大，地域性强，价格低廉，有机质含量高，含水量普遍在60%以上。使用时注意调和pH、重金属。
烟末烟梗：此类物料有机质、养分、糖类都较高，在作为有机肥的主要原料的产品肥力效果好，还有抑制杂菌，抵抗土壤虫害的效果，价格也较低廉。
氨基酸渣：蛋白含量高，多在40%以上，多数有味道也多为湿料，价格中下等，需烘干和晾晒，做成有机肥味道较重，肥力效果好。
有机肥料的原料还包括一些如餐厨垃圾、淤泥、草木灰、火山灰、城市生活污泥等。值得注意的是许多劣质的有机肥原料也来自于此。以下几种原料有机肥不建议大家使用
城市污水沉淀的污泥：虽然含有一定量的有机质和氮磷钾成分，这类原料不用花钱，加工成本很低，但重金属和大肠杆菌严重超标，易引发死根、死树现象，果实人吃后易引发恶性癌变。
工业废水沉淀的污泥：这类污泥虽然也含有大量元素和有机质，但是，重金属也是严重超标，可引发烂根、死树，严重污染土壤。
造纸厂的下脚料：这种肥料，主要成分是木质素。是极难吸收的一种有机质，何况在造纸的过程中要加进许多化学原料，而且这些原料绝大部分存留在下脚料里，它对土壤的破坏很大，对树根的影响很大。
风化煤：它属于表观的有机质，不能成为土壤微生物的碳源，风化煤中真正有效成分是腐植酸，但不深加工是无效的有机养分。
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